Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Rpusd3Q14AI6 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Rpusd3Q14AI6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Rpusd3Q14AI6 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Rpusd3Q14AI6 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Rpusd3Q14AI6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Rpusd3Q14AI6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Rpusd3Q14AI6 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Rpusd3Q14AI6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Rpusd3Q14AI6 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Rpusd3Q14AI6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Rpusd3Q14AI6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Rpusd3Q14AI6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Rpusd3Q14AI6 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Rpusd3Q14AI6 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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Rpusd3Q14AI6 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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