Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Spatc1Q148B6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Spatc1Q148B6 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms