Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ccdc162pQ0VG85 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms