Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Samd12Q0VE29 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms