Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Vps8Q0P5W1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Vps8Q0P5W1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms