Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
TrioQ0KL02 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
TrioQ0KL02 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms