Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc4Q08624 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Hoxc4Q08624 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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