Protein–RNA interactions for Protein: Q08535

Sct, Secretin, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SctQ08535 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SctQ08535 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SctQ08535 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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SctQ08535 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SctQ08535 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SctQ08535 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SctQ08535 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SctQ08535 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SctQ08535 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SctQ08535 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SctQ08535 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SctQ08535 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SctQ08535 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SctQ08535 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SctQ08535 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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SctQ08535 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SctQ08535 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SctQ08535 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SctQ08535 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SctQ08535 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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SctQ08535 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SctQ08535 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SctQ08535 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SctQ08535 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SctQ08535 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SctQ08535 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SctQ08535 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SctQ08535 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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SctQ08535 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SctQ08535 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SctQ08535 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SctQ08535 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SctQ08535 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SctQ08535 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SctQ08535 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SctQ08535 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SctQ08535 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SctQ08535 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SctQ08535 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SctQ08535 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SctQ08535 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms