Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Siah1bQ06985 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms