Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cxcr5Q04683 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms