Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Thbs2Q03350 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms