Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gjb4Q02738 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms