Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Apoa1Q00623 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms