Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lig3P97386 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms