Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccl21cP86793 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccl21cP86793 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ccl21cP86793 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Ccl21cP86793 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccl21cP86793 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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