Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SgcdP82347 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SgcdP82347 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SgcdP82347 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SgcdP82347 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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