Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

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Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gabpb2P81069 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gabpb2P81069 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gabpb2P81069 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gabpb2P81069 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gabpb2P81069 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gabpb2P81069 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gabpb2P81069 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Gabpb2P81069 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gabpb2P81069 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms