Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Irx1P81068 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Irx1P81068 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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Irx1P81068 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx1P81068 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx1P81068 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Irx1P81068 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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