Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Irx3P81067 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Irx3P81067 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx3P81067 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Irx3P81067 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms