Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Usp9xP70398 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms