Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Msx3P70354 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Msx3P70354 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms