Protein–RNA interactions for Protein: P62270

Rps18, 40S ribosomal protein S18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps18P62270 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rps18P62270 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps18P62270 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms