Protein–RNA interactions for Protein: P61079

Ube2d3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d3P61079 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ube2d3P61079 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Ube2d3P61079 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ube2d3P61079 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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