Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ppfia3P60469 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms