Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ctdsp1P58466 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms