Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
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Cldn18P56857 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cldn18P56857 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cldn18P56857 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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