Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CckbrP56481 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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