Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Irf5P56477 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Irf5P56477 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Irf5P56477 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Irf5P56477 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Irf5P56477 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Irf5P56477 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Irf5P56477 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Irf5P56477 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Irf5P56477 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Irf5P56477 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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