Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
GferP56213 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
GferP56213 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
GferP56213 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms