Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rrp1P56183 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms