Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rad23aP54726 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rad23aP54726 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.8 ms