Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Map3k1P53349 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Map3k1P53349 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms