Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

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Length 777 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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