Protein–RNA interactions for Protein: P48772

Cox8b, Cytochrome c oxidase subunit 8B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox8bP48772 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Cox8bP48772 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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