Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rpl13P47963 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms