Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprkP35822 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprkP35822 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprkP35822 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprkP35822 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprkP35822 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprkP35822 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprkP35822 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprkP35822 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprkP35822 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms