Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cxcr2P35343 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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