Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Saa4P31532 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Saa4P31532 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms