Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl3P27659 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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