Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NdnP25233 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NdnP25233 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
NdnP25233 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
NdnP25233 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms