Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PparaP23204 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PparaP23204 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PparaP23204 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PparaP23204 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms