Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Klra1P20937 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Klra1P20937 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms