Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ms4a2P20490 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ms4a2P20490 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms