Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
P18530 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
P18530 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
P18530 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18530 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18530 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18530 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18530 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18530 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18530 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18530 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18530 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18530 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18530 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18530 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
P18530 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18530 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
P18530 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms