Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PtpraP18052 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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PtpraP18052 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PtpraP18052 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms