Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ass1P16460 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ass1P16460 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ass1P16460 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms