Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
DmdP11531 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
DmdP11531 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
DmdP11531 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
DmdP11531 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
DmdP11531 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
DmdP11531 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
DmdP11531 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
DmdP11531 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
DmdP11531 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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