Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxc6P10629 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxc6P10629 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms