Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Hoxa5P09021 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms