Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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